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Diversidade genética entre acessos de capim-elefante obtida com marcadores moleculares R. Bras. Zootec.
Pereira,Antonio Vander; Machado,Marco Antonio; Azevedo,Ana Luisa Sousa; Nascimento,Carlos Souza do; Campos,Ana Lúcia; Lédo,Francisco José da Silva.
Este trabalho foi realizado para estimar a diversidade genética de 30 acessos de capim-elefante utilizando-se marcadores moleculares. Amostras de DNA genômico de cada acesso foram obtidas para realização da amplificação por PCR utilizando a técnica de marcadores RAPD. Foram utilizados 20 primers aleatórios que geraram 88 bandas de DNA de alta intensidade e reprodutíveis (64 bandas polimórficas e 24 monomórficas). Os acessos foram agrupados pelo método UPGMA com base na estimativa das distâncias genéticas. Os grupos de acessos Porto Rico, Santa Rita e IJ-7136 cv. EMPASC 307 e; Mineiro e Mineiro Ipeaco apresentaram distância genética nula entre si, comprovando tratar-se do mesmo material genético com designação diferente. Alguns pares de acessos apresentaram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Marcadores moleculares; Pennisetum purpureum; RAPD; Variabilidade genética.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008000700011
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Diversidade genética entre híbridos de laranja-doce e tangor 'Murcott' avaliada por fAFLP e RAPD PAB
Bastianel,Marinês; Oliveira,Antonio Carlos de; Cristofani,Mariângela; Machado,Marcos Antônio.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética em uma população de 148 híbridos de tangor 'Murcott' (Citrus reticulata Blanco x C. sinensis L. Osbeck) e laranja 'Pêra' (C. sinensis L. Osbeck) obtidos por polinização controlada, pelo uso de marcadores fAFLP e RAPD. Marcadores polimórficos (416 marcadores fAFLP e 33 RAPD) foram utilizados para avaliar a similaridade genética entre os híbridos, calculada com o coeficiente Jaccard pelo método UPGMA. A consistência de cada agrupamento foi determinada pelo programa BOOD. Houve alta similaridade genética entre os parentais. A laranja 'Pêra' apresentou maior número (132) de loci em heterozigose em relação ao tangor 'Murcott' (105), corroborando a teoria de origem híbrida para a laranja-doce....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Citros; Marcadores moleculares; Similaridade genética.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006000500009
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Diversidade genética molecular entre cultivares e híbridos de Brachiaria spp. e Panicum maximum Ciência Rural
Almeida,Mariana Castro da Costa; Chiari,Lucimara; Jank,Liana; Valle,Cacilda Borges do.
A utilização de marcadores moleculares pode servir para direcionar cruzamentos, confirmar novos híbridos e identificar genótipos para fins comerciais. Nesse contexto, o objetivo deste trabalho foi analisar a diversidade genética entre cultivares e híbridos de Brachiaria spp. e Panicum maximum usando marcadores moleculares do tipo RAPD (Polimorfismos de DNA amplificados ao acaso). Foram 22 genótipos analisados com 10 primers, os quais amplificaram 178 fragmentos polimórficos de DNA, que foram usados para estimar a similaridade genética por meio do coeficiente de Jaccard. Os valores de similaridade obtidos variaram de 0,066 a 0,841. A estrutura genética entre todos os genótipos estudados foi estimada pelo método UPGMA (Método de agrupamento com médias...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Brachiaria spp.; Forrageiras; Marcadores moleculares; Panicum maximum; RAPD.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782011001100024
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Eficiência dos métodos de otimização simulatedannealin, delineação rápida em cadeia e ramos e conexões para construção de mapas genéticos Ciência e Agrotecnologia
Nomelini,Quintiliano Siqueira Schroden; Silva,Heyder Diniz; Faria,Tiago Costa.
Um mapa genético é um diagrama onde são representados os genes com suas respectivas posições no cromossomo. Eles são essenciais para o procedimento de localização de genes envolvidos no controle genético de caracteres quantitativos ou no controle de outros caracteres de interesse econômico. No presente trabalho avalia-se, via simulação computacional de dados, a eficiência dos algoritmos simulated annealing, delineação rápida em cadeia e ramos e conexões, para a construção de mapas genéticos. Nas condições avaliadas, o algoritmo ramos e conexões foi o mais rápido, sendo que tanto este, quanto a delineação rápida em cadeia apresentaram 100% de eficiência. A eficiência do simulated annealing para ordenação de marcadores variou com o número de marcadores, para...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Delineação rápida em cadeia; Ramos e conexões; Marcadores moleculares; Ordenação.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542009000600011
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Estimación de la diversidad genética del Nopal, usando marcadores moleculares tipo AFLP Phyton
García-Zambrano,EA; Zavala-García,F; Gutiérrez-Diez,A; Ojeda-Zacarías,MC; Cerda- Hurtado,I.
El presente estudio tiene por objetivo aplicar la técnica de los marcadores moleculares tipo AFLP para la estimación de la diversidad genética en nopal dentro del Banco de Germoplasma de la FAUANL, donde se han reportado 12 accesiones como posibles duplicados por medio de marcadores moleculares tipo RAPD. El método utilizado para la extracción de ADN fue el del ruptor celular. El ADN fue digerido y ligado, para posteriormente realizar una preamplificación y después la amplificación selectiva. Los fragmentos amplificados fueron luego separados y analizados. Se concluyó que ninguna de las accesiones estaba duplicada. Esto se debió a que en el dendograma generado al usar el método de UPGMA se formaron 8 grupos. Dos de estos grupos lo integraron 3 accesiones...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Marcadores moleculares; AFLP; Accesiones.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1851-56572009000200006
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Estimación de los parámetros biométricos de los QTL en poblaciones F 2: un nuevo enfoque Agrociencia
Cerón-Rojas,J. Jesús; Sahagún-Castellanos,Jaime.
Resumen Los procedimientos estándar para construir mapas de loci de caracteres cuantitativos (QTL o QuantitativeTrait Loci, por sus siglas en inglés) se basan en la estimación por máxima verosimilitud o mínimos cuadrados de los parámetros biométricos del QTL y generalmente requieren métodos numéricos y software especial, ya que no producen estimadores explícitos. El objetivo del presente trabajo fue derivar estimadores explícitos de los parámetros biométricos de un QTL en una población F2. La derivación se basó en tres combinaciones lineales de variables aleatorias con distribución normal mezclada y un marcador molecular. Para cada combinación lineal se determinaron su media y varianza y, con éstas, se derivaron estimadores del efecto aditivo y del efecto...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Caracteres cuantitativos; Distribuciones mezcladas; Frecuencia de recombinación; Marcadores moleculares; Perfil de verosimilitud.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1405-31952007000100057
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Estructura genético-isonímica del noroeste Argentino JBAG
Dipierri,José E; Alfaro,Emma L; Bailliet,Graciela; Bravi,Claudio; Albeck,Maria E; Muzzio,Marina; Ramallo,Virginia; Motti,Josefina María Brenda.
El objetivo de este trabajo es profundizar el estudio de la estructura poblacional del NOA recurriendo al análisis de la distribución y frecuencia de apellidos por el método isonímico y a la utilización de marcadores genéticos a partir de un esfuerzo colaborativo de varias instituciones e investigadores. Para ello se utilizaron marcadores sanguíneos (ABO, HLA), cromosoma Y, ADNmt y análisis genómico total y se determinaron frecuencias alélicas y de haplogrupos, se analizó la diversidad genética intra e interpoblacional y se construyeron dendrogramas. Para evaluar el mestizaje en el NOA iniciado en la segunda mitad del siglo XVII se calcularon porcentajes de miscegenación usando como referencia frecuencias alélicas de las poblaciones parentales (europea,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Apellidos; Marcadores moleculares; Estructura de población; NOA.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1852-62332011000200001
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Estudo comparativo através de análises de RAPD de seis espécies da família Pimelodidae (Osteichthyes, Siluriformes) do rio Tibagi, Estado do Paraná, Brasil Biological Sciences
Almeida, Fernanda Simões de; USP; Sodré, Leda Maria Koelblinger; UEL.
A similaridade genética de seis espécies, pertencentes à família Pimelodidae (Osteichthyes, Siluriformes), coletadas em quatro localidades na bacia do rio Tibagi, foi analisada utilizando-se a técnica de RAPD. A análise comparativa de RAPD foi realizada para observar o grau de similaridade genética entre seis espécies de Pimelodidae. O dendrograma obtido através da análise comparativa dos padrões de RAPD mostrou claramente que os indivíduos estudados de cada uma das espécies se agrupam entre si, ou seja, há uma separação definida entre as seis espécies. Dois agrupamentos foram obtidos, um formado pelas espécies P. maculatus, P. cf. absconditus, I. labrosus e P. pirinampu (Subfamília Pimelodinae), e outro formado pelas espécies P. aff. avanhandavae e...
Palavras-chave: 2.00.00.00-6 Ciências Biológicas Pimelodidae; Marcadores moleculares; RAPD 2.00.00.00-6 Ciências Biológicas.
Ano: 2002 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciBiolSci/article/view/2352
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Evaluación fenotípica y molecular de alelos de los genes Ppd-1 en una población biparental de trigo pan Agriscientia (Córdoba)
Lombardo,L. A.; Nisi,M. M.; Ghione,C. E.; Fisore,G. D.; Helguera,M..
El constante incremento de las temperaturas -como consecuencia del cambio climático- en las regiones donde se cultiva trigo, exige ajustar el ciclo del cultivo a períodos más cortos para evitar o disminuir los estreses causados por las altas temperaturas. En este sentido, el descubrimiento de fuentes genéticas innovadoras de modulación de la espigazón, así como también el desarrollo de herramientas moleculares que permitan capitalizarlas, tienen un rol central en el mejoramiento de este cultivo. En el presente estudio se evalúa, bajo condiciones controladas, el efecto de los genes Ppd-1 sobre la espigazón en una población biparental de trigo pan. Para tal fin, se desarrollaron marcadores moleculares inéditos para los genes Ppd-A1 y Ppd-B1. Los resultados...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Trigo; Fotoperíodo; Ppd-1; Marcadores moleculares.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1668-298X2017000200005
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Genes do eixo somatotrófico e características de crescimento numa população F2 de bovinos PAB
Silva,Marcos Vinicius Gualberto Barbosa da; Martinez,Mário Luiz; Machado,Marco Antonio; Nascimento,Carlos Souza do; Campos,Ana Lúcia; Guimarães,Marta Fonseca Martins; Azevedo,Ana Luisa Sousa; Moita,Antônia Kécya França; Lui,Jeffrey Frederico.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a associação dos polimorfismos dos genes bGH, IGF-1 e PIT-1 com características de peso e ganho de peso numa população F2 de bovinos (Gir x Holandês), pela técnica de PCR-RFLP. As freqüências alélicas A e B, do gene PIT-1, e dos genótipos AA, AB e BB, nas populações parentais foram semelhantes entre si, mas diferentes das freqüências nas populações cruzadas F1 e F2, para esse gene. Quanto ao gene bGH, os animais da raça Holandesa apresentaram freqüência de 100% para o alelo E e os animais da raça Gir, 92% para o alelo F, resultando em alta freqüência de indivíduos heterozigotos nas populações F1 e F2. Quanto ao gene IGF-1, todos os animais da raça Holandesa eram heterozigotos (AB) e, nos animais Gir, a maioria dos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Marcadores moleculares; PCR-RFLP.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006000600013
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Genome wide selection (GWS) and maximization of the genetic improvement efficiency PFB - Pesquisa Florestal Brasileira
Resende, Marcos Deon Vilela de; Lopes, Paulo Sávio; Silva, Rogério Luíz da; Pires, Ismael Eleotério.
Genetic selection has been practiced by the best linear unbiased prediction (BLUP) method using phenotypic records. A first proposal for enhancement of the efficiency of this procedure was the marker assisted selection (MAS). Later, another method called genome wide selection - GWS was reported, which presents high accuracy for the selection based exclusively on markers, after predicting their genetic effects from phenotypic data in a sample of the population of selection. GWS is excellent for low heritable traits, while MAS is not. This paper presents the GWS methodology and simulates a case of its application, aiming at emphasizing its advantages over MAS. The relation between traditional BLUP and genomic BLUP is also detailed as well as the sample size...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genomic selection linkage disequilibrium analysis fine mapping genetic markers. Seleção genômica; Análise de desequilíbrio de ligação; Mapeamento fino; Marcadores moleculares.
Ano: 2010 URL: http://pfb.cnpf.embrapa.br/pfb/index.php/pfb/article/view/63
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Genómica bovina: Dónde estamos. Hacia dónde vamos JBAG
Corva,Pablo M.
Las tecnologías basadas en el análisis de ADN con aplicación en producción animal han experimentado un enorme desarrollo, como resultado del crecimiento de la investigación en genómica en todas las especies. Las aplicaciones concretas son el aprovechamiento de la variabilidad del ADN para la caracterización de poblaciones y la identificación animal, la detección de portadores de variantes alélicas indeseables y la selección asistida por marcadores. Esta última es la aplicación que más expectativas ha despertado en el sector productivo. En este caso, la información obtenida directamente del ADN del individuo permitiría reducir la necesidad de información fenotípica, lo que a su vez tendría un impacto directo sobre la tasa de progreso genético al aumentar la...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genómica; Bovinos; Marcadores moleculares; Selección asistida.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1852-62332010000200013
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Genotipagem de polimorfismos associados com sistemas de macho-esterilidade em acessos de cebola adaptados ao Brasil Horticultura Brasileira
Ragassi,Carlos Francisco; Santos,Maria do Desterro M dos; Fonseca,Maria Esther de N; Oliveira,Valter R; Buzar,Anne Giselle R; Costa,Cyro P da; Boiteux,Leonardo S.
A produção em escala comercial de sementes híbridas de cebola (Allium cepa) tem sido conduzida com o emprego de dois sistemas de macho-esterilidade do tipo genética-citoplasmática (CMS-S e CMS-T) em associação ao citoplasma normal (macho-fértil). No entanto, a análise molecular desses diferentes tipos citoplasmáticos ainda não está disponível para um grande número de acessos de cebola adaptados para cultivo em regiões tropicais. Além de adaptação às condições edafoclimáticas do Brasil, muitos desses acessos apresentam tolerância a doenças, sendo de potencial valor como genitores de híbridos. O presente trabalho visou identificar os tipos citoplasmáticos de acessos de cebola de diferentes grupos morfoagronômicos de interesse para o melhoramento genético no...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Allium cepa; Marcadores moleculares; Genoma mitocondrial; Macho-esterilidade genética-citoplasmática; Melhoramento genético.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362012000300009
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Herança da resistência à antracnose na cultivar de feijoeiro comum Cornell 49-242 Trop. Plant Pathol.
Marin,Ana Lilia A.; Costa,Márcia Regina; Menarim,Henrique; Moreira,Maurilio A.; Barros,Everaldo G..
A cultivar de feijoeiro (Phaseolus vulgaris) Cornell 49-242, possuidora do gene de resistência Co-2 (Are), é uma das mais antigas fontes de resistência à antracnose, causada por Colletotrichum lindemuthianum. Visando a utilização desta fonte no programa de piramidação de genes em cultivares do tipo "carioca" do BIOAGRO/UFV, este trabalho teve como objetivos: (1) definir o padrão de herança da resistência da cultivar de feijoeiro Cornell 49-242 em cruzamentos com cultivares suscetíveis às raças 81 (Rudá) e 65 (Rudá e Ouro Negro) de C. lindemuthianum e (2) avaliar o marcador RAPD OPQ04(1440C) ligado ao gene Co-2 em populações F2 do cruzamento Rudá vs. Cornell 49-242. Os resultados indicaram que três genes dominantes, sendo dois de caráter complementar,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/other Palavras-chave: Colletotrichum lindemuthianum; Phaseolus vulgaris; Marcadores moleculares; Genes da resistência.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582003000300013
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Huella genética de siete razas de maíz de Valles Altos de México. Colegio de Postgraduados
Rocandio Rodríguez, Mario.
Dentro de la diversidad del maíz (Zea mays L.) de México, uno de los grupos de mayor interés es el del complejo piramidal que se cultiva en Valles Altos centrales de México. Con la finalidad de caracterizar la diversidad genética de siete razas de maiz de Valles Altos, se realizó un estudio utilizando variables morfológicas y marcadores moleculares (SSRs). Se hizo, además, un análisis simultáneo de los datos disponibles sobre dos líneas de evidencia, para hacer clasificaciones más robustas. Se incluyeron entre 8 y 26 accesiones que han sido consideradas por diferentes autores como representativas de las razas Arrocillo Amarillo, Cónicos, Elotes Cónicos, Palomero Toluqueño, Chalqueño y Purépecha. La adquisición de semillas se realizó mediante solicitud a...
Palavras-chave: Zea mays L.; Diversidad genética; Marcadores moleculares; Teocintle; Análisis conjunto; Genetic diversity; Molecular markers; Teosinte; Joint analysis; Genética; Doctorado.
Ano: 2013 URL: http://hdl.handle.net/10521/2092
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Identificação de loci microssatélitescom potencial de amplificação na espécie de Peixe-Rei (Odontesthes humensis) Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Tavares,R.A.; Piedras,S.R.N.; Nunes,M.D.; Almeida,D.B.; Moreira,C.G.A.; Fernandes,J.M.; Freitas,S.F.; Moreira,H.L.M.; Pouey,J.L.O.F.; Dionello,N.J.L..
In this work, 25,806 potentially amplifiable microsatellite loci (PAL) were identified in pejerrey, (Odontesthes humensis), with 21% of dinucleotide, 22% trinucleotide, 37% tetranucleotide, 13% pentanucleotide and 7% hexanucleotide. Of the total loci, 167 were classified as "Best PAL", more likely to be variables in populations. The results show that with a small coverage of the genome it was possible to identify a large number of microsatellite loci.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Peixe-rei; Microssatélites; Marcadores moleculares; PAL.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352014000601941
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Identificação de populações de insetos-praga utilizando marcadores moleculares RAPD. Infoteca-e
QUEIROZ, P. R.; MARTINS, É. S.; PRAÇA, L. B.; LIMA, L. H. C.; MONNERAT, R. G..
bitstream/CENARGEN/29389/1/bp167.pdf
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Insetos-praga; Identificação de populações; Marcadores moleculares; RAPD.; Controle Biológico..
Ano: 2007 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/183144
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Identificação de QTL associados à simbiose entre Bradyrhizobium japonicum, B. elkanii e soja PAB
Santos,Maria Aparecida dos; Nicolás,Marisa Fabiana; Hungria,Mariangela.
O objetivo deste trabalho foi identificar QTL (locos de caráter quantitativo), utilizando marcadores do tipo microssatélites (SSR), relacionados à fixação biológica de nitrogênio (FBN), em uma população F2:7 de cultivares de soja (Glycine max) com diferentes capacidades de FBN, Bossier (alta) e Embrapa 20 (média). Foram mapeados 16 marcadores, distribuídos em seis grupos de ligação, cobrindo uma região de 5% do genoma (151,6 cM). A análise de regressão identificou 12 associações significativas em quatro grupos de ligação (B1, C2, D1b e H): três para a massa da parte aérea seca, quatro para número de nódulos, duas para a massa de nódulos e três para a massa média de nódulos. Todos os QTL detectados foram de efeitos menores. Contudo, sete marcadores foram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fixação biológica do nitrogênio; Marcadores moleculares; Mapa genético; Microssatélites; Nodulação; SSR.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006000100010
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Identificación de cultivares de trébol blanco (Trifolium repens L.) mediante SSR JBAG
Randazzo,C.P; Rosso,B.S; Pagano,E.M.
El trébol blanco (Trifolium repens L) es una leguminosa forrajera de gran valor nutritivo y muy eficiente en la incorporación de nitrógeno (N) al suelo mediante fijación simbiótica. En Argentina se ha difundido ampliamente en las regiones húmeda y subhúmeda. Los objetivos del presente trabajo fueron i) detectar la capacidad de marcadores moleculares microsatélites (SSR) para la diferenciación genética e identificación de cultivares de trébol blanco y ii) determinar la relación entre los agrupamientos de los cultivares basados en marcadores moleculares y caracteres agronómicos. Se analizaron 24 cultivares de trébol blanco y dos de trébol rojo de diversos orígenes. Se utilizaron 15 SSR marcados con fluorescencia. Los productos de PCR fueron separados en...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Marcadores moleculares; Microsatélites; Trébol blanco; Cultivares.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1852-62332013000100003
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Identificación de polimorfismos en genes candidatos de resistencia en yuca (Manihot esculenta Crantz) Acta Agron. (Palmira)
Vásquez,Andrea; López,Camilo E.
La yuca (Manihot esculenta) es la base de la alimentación para más de 1000 millones de personas en el mundo. La producción es severamente afectada por enfermedades ocasionadas por diferentes patógenos. Las plantas de yuca han desarrollado una serie de proteínas de resistencia (R) para defenderse de infecciones virales, bacterianas y fúngicas, las cuales son capaces de reconocer moléculas específicas de los patógenos. Un repertorio amplio de estas proteínas ha sido identificado en varias especies vegetales, no obstante, a pesar de conferir resistencia a patógenos diversos, presentan unos pocos dominios conservados. A partir de la reciente liberación de la secuencia completa del genoma de yuca se identificaron secuencias similares a proteínas R en este...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genomas; Manihot esculenta; Mapas genéticos; Marcadores moleculares; Resistencia a patógenos; Yuca.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122012000200006
Registros recuperados: 143
Primeira ... 12345678 ... Última
 

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